1、晚餐吃纳豆效果最好。通过实验，专家认为：食用纳豆1小时至12小时之间纳豆激酶发挥溶解血栓的功能。而据统计脑梗塞、心肌梗塞等各种血栓病，发病时间多为清晨及星期一。因此每晚或星期日晚餐吃效果最好。
2、尽可能不加热吃。纳豆激酶不耐热，加热到70℃活性就消失了。所以生吃效果最好。
3、必须坚持每天吃。纳豆激酶进入体内后，其活性维持12小时。所以尽可能每天吃30～100g最理想。
4、保质期稍过也能吃。纳豆的保质期为一周，它在冰箱内低温保存过程中，还在进行着缓慢的低温熟成发酵，纳豆激酶和维生素K2也在不断增加。但保质期过后虽然也能吃，只是纳豆菌为了生存不断分解蛋白质，其结果臭味逐渐增加。
纳豆推荐吃法——
1、加生抽拌食，现拌现吃。
2、把纳豆放在热乎乎的米饭上面吃，就是日本传统的纳豆拌饭；
3、纳豆从冰冻柜取出自然解冻就可以吃了，注意不要将纳豆处理得过热，以免纳豆菌死灭，失去其应有的营养价值；
4、不喜纳豆臭味，可以加些香味大的食物。如圆葱、大白萝卜末、小蒜苗、海带、芝麻、朝鲜辣白菜等。
