牡蛎的营养价值非常高，素有“海底牛奶”之美称。牡蛎不仅肥美爽滑、味道鲜美，还富含蛋白质、脂肪、肝糖元、维生素、牛磺酸、钙、磷、铁、锌等多种营养成分。
据科学分析，每100克鲜牡蛎的可食部分含蛋白质10.9克，脂肪1.5克，钾200毫克，钠462毫克，钙131毫克，镁65毫克，锌9.39毫克，铁7.1毫克，铜11.5毫克，磷115毫克，硒86微克，维生素A27微克，烟酸1.4毫克。
牡蛎的含碘量远远高出牛奶和蛋黄，牡蛎中还含有海洋生物特有的多种活性物质及多种氨基酸。此外，牡蛎还含有多种维生素及牛磺酸和钙、磷、铁、锌等营养成分。钙含量接近牛奶的1倍，铁含量为牛奶的21倍，是健肤美容和防治疾病的珍贵食物。
牡蛎含锌量之高，可为食物之冠，是含锌最多的天然食品之一，每天只吃2～3个牡蛎就提供你全天所需的锌。锌的巨大价值体现在它是男性生殖系统里至关重要的矿物质，尤其是近五十年男性的精子数量下降明显，更需补充足够的锌。
牡蛎中所含的亮氨酸、精氨酸、瓜氨酸含量最丰富，是迄今为止人类所发现的含量最为高的海洋物种之一。
