2009全国手足口病大爆发的时候，国家中医药管理局组织相关专家在总结各地手足口病中医药治疗经验的基础上，制定了《中医药防治手足口病临床技术指南（2009年版）》，提供给各医疗机构在临床工作中参考。
自2014年5月份以来，我国各地再次陆续出现手足口病爆发的情况，为了方便各在医疗机构作为临床参考，所以再次将这份《中医药防治手足口病临床技术指南（2009年版）》发布到网上。
《中医药防治手足口病临床技术指南（2009年版）》原文如下——
手足口病是由多种肠道病毒引起的常见传染病，多见于婴幼儿，历年均有发生，中医药在临床实践中积累了一定的经验。参照卫生部颁布的《手足口病诊疗指南（2008年版）》，在总结中医药治疗手足口病临床经验的基础上，结合今年部分地区患者的临床特点及中医药的使用情况，特制定本指南。
一、证治方案
手足口病属于中医“温病”范畴，湿热疫毒经口鼻而入，发于手足，上熏口咽，外透肌肤，发为疱疹，并见发热、倦怠、恶心、便秘等症状；或邪毒内陷，出现高热、抖动、肢体痿软，甚则发生喘、脱，危及生命。
婴幼儿系稚阴稚阳之体，感受疫毒后，病情变化迅速，宜早发现，早治疗，防变证。
（一）普通型
临床主要表现为：发热，口腔黏膜出现散在疱疹，手、足和臀部出现斑丘疹、疱疹，疱疹周围可有红晕，伴咽痛、流涎，倦怠，纳差，大便多秘结，舌淡红或红，苔腻，脉数，指纹红紫。
治法：清热解毒，化湿透邪。
参考处方：金银花、野菊花、黄连、生石膏（先下）、知母、紫草、白茅根、青蒿、藿香、生甘草，药物用量根据患儿年龄、体重、病情等酌定。
用法：水煎分3～4次口服，或灌肠、直肠点滴。
加减：
1．高热、抖动、易惊加羚羊角粉冲服；
2．便秘加生大黄；
3．咽喉痛加元参、板蓝根；
4．咳嗽加杏仁、炙杷叶。
中成药：蓝芩口服液、小儿豉翘颗粒、清开灵口服液、黄栀花口服液、金莲泡腾片，也可选用炎琥宁注射液、痰热清注射液等。
