3、等发酵容器中的牛奶变稠，变凝固时即可停止发酵。此时就可以进行下面的步骤了，如果不能及时进行下面的步骤，也可以先把发酵容器放入冰箱里冷藏保存。
4、将容器中的酸奶轻轻的充分搅拌均匀，让酸奶变成糊状，然后倒入滤网中，一边抖动一边用塑料小勺轻轻拨动酸奶，这样能让酸奶更容易滤出来，最后留在滤网中的东西就是菌种。
这是留在滤网中的菌种
5、用凉开水把滤网中的菌种简单的冲洗干净(不洗也行，但实践证明洗过以后的菌种发酵效果更好，我通常是做过五六次以后就冲洗一次)。
6、洗过以后的菌种再放到发酵容器中，添加200毫升纯牛奶，重复上述步骤，如此循环往复，我们就可以不断的得到开菲尔酸奶和菌种了。
补充说明：
1、用滤网过滤出来的酸奶就是开菲尔酸奶，而留在滤网中的东西就是开菲尔菌种，它可以当作下一次发酵的菌种。
2、第一次发酵加入100毫升纯牛奶就足够了，第二次发酵可以加入200毫升纯牛奶，重复制作的次数越多，得到的菌种数量就越多，可以制作的酸奶量也越来越多。
3、制作开菲尔酸奶所用的工具必须是非金属的，塑料、陶瓷或玻璃的都可以，但绝对不能使用金属工具，切记，这是很关键的。
4、牛奶必须是纯牛奶，高钙奶、脱脂奶或奶粉等都不能使用，盒装、袋装或刚挤的新鲜牛奶都可以，煮开放凉后就可以使用了。
5、第一次制作的开菲尔酸奶非常酸，但随着纯牛奶数量的增多，酸度会慢慢地降低到正常水平。
6、开菲尔菌种能够适应的温度范围很广，一般室温下都可以正常发酵，温度越高发酵越快，但超过40摄氏度可能会失去活性甚至慢慢死亡。
7、发酵容器在发酵的过程中也不能完全密封，因为发酵过程会产生一些气体，密封过严有可能撑破容器，必要的时候还需要隔段时间打开一次，放放气再马上盖上。
开菲尔菌种的保存方法
如果你不断的重复制作开菲尔酸奶，最后得到的菌种就会越来越多。用不完的菌种可以用适量牛奶泡上，密封后放在冰箱冷藏室里，放7天至14天左右不管不问都没有问题。
用不完的菌种还可以放入凉开水中，再放入冰箱里冷冻保存，一年不管理取出来照样可以用。但是，经过冷冻的菌种恢复活性比较慢，要经过多次发酵才能完全恢复其活性。
如果你不打算保存菌种，完全可以把菌种送给别人使用，或者把菌种和酸奶一起喝掉，因为菌种富含多种有益健康的益生菌，而且是充满活力的益生菌。
